Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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