Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufm1P61961 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms