Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SnnP61807 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SnnP61807 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SnnP61807 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SnnP61807 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SnnP61807 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms