Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vps33bP59016 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps33bP59016 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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