Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ctdsp1P58466 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ctdsp1P58466 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ctdsp1P58466 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Ctdsp1P58466 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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