Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntfP51642 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntfP51642 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntfP51642 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CntfP51642 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntfP51642 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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