Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa11P50709 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa11P50709 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms