Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TspoP50637 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TspoP50637 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TspoP50637 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms