Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab11bP46638 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms