Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Tnfsf9P41274 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfsf9P41274 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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