Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f3P31361 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms