Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hoxc11P31313 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hoxc11P31313 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hoxc11P31313 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxc11P31313 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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