Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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