Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkchP23298 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PrkchP23298 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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