Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PparaP23204 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PparaP23204 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PparaP23204 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PparaP23204 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PparaP23204 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms