Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a2P20490 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a2P20490 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms