Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms