Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P20040 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P20040 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
P20040 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
P20040 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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