Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csn1s1P19228 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms