Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18524 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18524 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18524 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms