Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga5P11688 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga5P11688 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms