Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms