Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms