Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P10404 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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P10404 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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P10404 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P10404 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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