Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LtaP09225 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtaP09225 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtaP09225 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LtaP09225 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms