Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxa6P09092 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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