Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna6P07350 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna6P07350 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms