Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-Eb1P04230 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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H2-Eb1P04230 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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H2-Eb1P04230 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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H2-Eb1P04230 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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