Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HbaP01942 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HbaP01942 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HbaP01942 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.6 ms