Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01645 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01645 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01645 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms