Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Cops6O88545 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops6O88545 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cops6O88545 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cops6O88545 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cops6O88545 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cops6O88545 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cops6O88545 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cops6O88545 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Cops6O88545 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cops6O88545 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops6O88545 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops6O88545 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops6O88545 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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