Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms