Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lnx1O70263 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms