Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms