Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Opn1mwO35599 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Opn1mwO35599 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Opn1mwO35599 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Opn1mwO35599 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Opn1mwO35599 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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