Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Clk2O35491 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clk2O35491 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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