Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E2f3O35261 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms