Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms