Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm4340L7N2C4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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