Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwa3bJ9JI28 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vwa3bJ9JI28 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms