Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm2035J3QP87 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms