Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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