Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ms4a18J3QN01 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ms4a18J3QN01 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ms4a18J3QN01 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ms4a18J3QN01 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a18J3QN01 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ms4a18J3QN01 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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