Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Gm20825J3QM67 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Gm20825J3QM67 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms