Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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