Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21818J3KMS6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21818J3KMS6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms