Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20830J3KML6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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