Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20828J3KMI7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms