Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms