Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Vmn1r34G3XA52 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Vmn1r34G3XA52 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Vmn1r34G3XA52 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Vmn1r34G3XA52 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vmn1r34G3XA52 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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